1. परिषद: इसका प्रधान कार्यालय, फ्रांस की राजधानी पेरिस में है। इसके अध्यक्ष विभिन्न देशों के, बारी-बारी रक्षा मंत्री होते हैं। इसके अलावा, कार्य संचालन के लिए, एक मुख्य सचिव होता है, जिसकी नियुक्ति परिषद करती है।
2. सैनिक परिषद: इस परिषद का मुख्य उद्देश्य, सैनिक मामलों में परामर्श देना होता है। 1950 में, परिषद ने, सोवियत संघ से, पश्चिमी यूरोप की रक्षा के लिए, सभी सदस्य राष्ट्रों की एक संयुक्त सेना का गठन किया। इसके सर्वोच्च सेनापति, अमेरिका के जनरल आइजनहावर को बनाया गया (अमेरिका के राष्ट्रपति - 1953-60)।
इसके अलावा नाटों की दो और कमाने हैं - अन्टारिक महासागर कमान और चैनल कमान। 1953 में, अमेरिका ने अपनी सेनाओं को, सोवियत संघ के विरूद्ध एटम हथियार से लैस कर दिया।